说实话，做了20年财税，见过太多企业老板把注销想得太简单——觉得不就是去税务局交个税、盖个章的事儿？去年有个张总，开了一家非上市股份公司，想着公司不干了就赶紧注销，结果前脚刚去市场监管局提交注销申请，后脚税务局就来了电话，说他公司2019年有一笔其他应收款没申报个税，补税加滞纳金一下多了20多万。当时张总就懵了：公司都注销了，怎么还有税？其实啊，这就是典型的对上海非上市股份有限公司注销需要办理哪些税务注销手续不了解，以为走个流程就行，结果栽在税务清算上。今天我就以20年从业经验，跟大家掰扯清楚，上海这边非上市股份有限公司注销，税务到底该怎么弄，别让注销变成坑销。<

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清算期间的税务大扫除，别留死角

先明确一点：上海非上市股份有限公司注销，税务注销不是终点，而是清算期的终点检查。根据《税务注销规程》（国家税务总局公告2020年第44号），企业要在清算期开始后，先向税务机关办理清算备案，然后才能进入正式注销流程。清算期嘛，通俗说就是公司停止营业、算总账的阶段，这个阶段的税务处理，就像搬家前的大扫除——每个抽屉都要翻，每个角落都要看，不然准有遗漏。

清算期要干啥？核心就两件事：一是把该交的税都交了，二是把该报的表都报了。增值税、企业所得税、个人所得税（股东分红、员工工资薪金这些）、印花税、土地使用税……只要公司存续期间欠的税，都得在这个阶段结清。我之前帮过一家做科技服务的非上市股份公司，清算时财务光顾着算固定资产处置损益，忘了公司还有一笔2018年的印花税没申报（当时签了一份技术合同，财务以为金额小不用交），结果税务局清算时直接查出来了，不光补税，还有0.05%每天的滞纳金，算下来比税本身还多。所以说，清算期不是简单算账，而是地毯式排查，增值税的进项转出、企业所得税的资产损失扣除、个税的股东分红扣缴……每一项都得按规矩来，不然后患无穷。

增值税清算，这3笔钱最容易出问题

增值税是税务注销中的大头，也是最容易踩坑的地方。上海这边对增值税清算审核特别细，尤其是非上市股份有限公司，涉及的业务多、历史遗留问题也可能多，我总结下来，有3笔钱最容易出问题：留抵税额、进项税额转出、免税项目处理。

先说留抵税额。有些公司注销时账上还有没抵完的进项税，就想当然以为注销了就没了，其实大错特错！根据《财政部 国家税务总局关于增值税期末留抵税额退税有关政策的公告》（财政部 税务总局公告2019年第84号），符合条件的企业是可以申请留抵退税的。我之前遇到一家做贸易的股份公司，清算时有50多万留抵税额，财务嫌麻烦不想申请，结果税务局注销审核时明确要求：要么申请退税，要么视同放弃，注销后无法追溯。最后只能老老实实申请退税，虽然流程麻烦了点，但钱总不能白扔。再说进项转出，清算期销售的商品、处置的固定资产，如果之前有留抵，现在销售了就得做进项转出，不然就少交税了。有个客户公司清算时卖了一批库存，财务忘了转出进项，被税务局查出来，不光补税，还按偷税处理，罚款0.5倍，得不偿失。还有免税项目，比如软件企业即征即退的增值税，清算时要算清楚已退税额对应的进项，该转出的也得转，不然容易多退税款。

企业所得税清算，清算所得怎么算才不吃亏

企业所得税清算比日常申报复杂得多，核心是清算所得的计算。根据《企业所得税法》第五十五条，企业应当在注销前，就清算所得向税务机关申报并缴纳企业所得税。清算所得怎么算？公式是：清算所得=企业的全部资产可变现价值或交易价格-资产的计税基础-清算费用-相关税费-等。这里面的可变现价值和计税基础最容易扯皮。

我印象最深的一个案例：上海有一家非上市股份公司，清算时把一台账面价值100万的设备卖了80万，财务觉得亏了20万，所得税不用交了，结果清算申报时被税务局驳回——因为设备的计税基础不是账面价值，而是当初购买时的价款加税费，假设这台设备买的时候是150万（含税费），那清算所得就是80万（可变现价值）-150万（计税基础）=-70万，确实不用交税；但如果财务按账面100万算，就会得出清算所得-20万的错误结论。所以说，资产处置的计税基础一定要按税法规定来，不能随便用账面价值。还有清算费用，比如清算组人员的工资、办公费，这些得有合法凭证，不然税前扣除不了。我见过有家公司清算时把老板的咨询费都算进清算费用，结果被税务局要求调增，补了25万企业所得税，真是得不偿失。

发票和税务资料，这些纸片片比你想的重要

很多老板觉得，公司注销了，发票、账簿这些旧东西扔了就行，在上海这可不行！发票和税务资料是税务注销的通行证，缺一样都可能卡住流程。

首先是发票缴销。公司注销前，必须把手里所有空白发票、已开发票的存根联都缴销给税务局。我之前帮一家公司注销时，财务说还有10份空白发票没用完，丢了算了，结果税务局直接不让注销——发票丢了得登报声明作废，还要罚款（按《发票管理办法》，丢失发票最高可处3万元罚款）。最后花了半个月登报、罚款，才把发票问题解决。其次是账簿凭证保存，根据《会计档案管理办法》，企业会计档案（包括账簿、凭证、报表等）要保存10年，注销后也不能随便扔。我见过有家公司注销后把账簿当废纸卖了，结果后来税务局查以前年度的印花税，没凭证无法证明，最后让股东承担了补税责任。所以说，发票和税务资料不是废纸，是证据，注销前一定要整理好，该缴的缴，该存存。

申请注销，这些细节决定快慢

清算完了、资料齐了，就可以向税务局申请税务注销了。上海这边现在税务注销流程已经简化了很多，线上通过电子税务局就能提交申请，但有些细节还是会影响审批速度。

比如资料清单，一定要按税务局要求准备齐全：注销登记申请表、清算报告、股东会决议、完税证明、发票缴销证明……缺一样都可能被打回。我之前有个客户，清算报告没找有资质的会计师事务所出，自己随便写了一份，结果税务局要求重新出具，耽误了20天。还有承诺制注销，根据《上海市税务局关于优化税务注销程序的公告》，符合条件的（比如未领票、未申报、无欠税）可以承诺制办理，当场就能出注销通知书。但要注意，承诺制不是随便承诺，如果承诺后发现有问题，会被列入失信名单，影响企业法人征信。我见过一家公司用承诺制注销后，被查出有欠税，不仅被追税，法人还被限制高消费，真是聪明反被聪明误。

上海加喜财税公司对财务凭证不完整，企业注销对知识产权有何影响？服务见解：财务凭证不完整是注销中的硬伤，不仅会导致税务清算受阻（无法确认成本费用、资产价值），更可能直接影响知识产权的处理。比如商标、专利等无形资产，若原始购买、研发凭证缺失，税务机关可能按核定征收方式确认转让所得，导致企业多缴企业所得税；若知识产权是股东投入，无评估报告和验资凭证，还可能涉及股东个税风险。加喜财税（https://www.110414.com）在处理此类问题时，会通过凭证追溯+合理补救方案，协助企业查找银行流水、合同等辅助证据，必要时通过第三方机构评估，确保知识产权价值合法确认，避免因小失大，让企业注销不留隐患。