要说注销药店里最让人头疼的事，库存药品处理绝对能排前三。我做了20年财税，见过太多老板因为库存没处理好，注销流程卡了半年，甚至被税务稽查补税罚款的。记得有个张老板，连锁药店加盟商，因为合同到期要注销，库存还有200多万药品，他想着直接报损不就行了，结果税务来查时，发现他连基本的进销存台账都没有，药品批号、效期一片混乱，最后不仅补了30多万增值税，还被药监部门罚了款，注销流程硬是拖了一年多。其实啊，注销药店时库存药品管理没那么复杂，关键是要合规、清晰、有凭证，今天我就以20年经验，跟大家好好聊聊这事。<

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第一步：全面清查盘点，账实相符是底线

注销药店库存管理的第一步，也是最重要的一步，就是把家底摸清——全面清查盘点。很多老板觉得我天天在店里，还不知道自己有多少药？但真到注销时，才发现问题一堆：比如有些药品被员工借走了没还，有些近效期药品被藏在角落，还有些滞销药品早就过了有效期却没下架。我之前帮过一个李姐，社区药店老板，她注销时自己盘了三天，结果我们专业团队介入后，又盘出近10万元的账外药品，都是她平时没注意的临期品，差点就漏报了。

清查盘点时，一定要按批号+效期+数量逐项登记，最好用Excel表格做台账，列清楚药品名称、规格、批号、生产日期、有效期、数量、进价、含税价这些基本信息。这里有个细节：近效期药品（一般指距离有效期不足6个月的）要单独标注，因为这类药品的处理方式和正常效期药品完全不同。冷藏药品、特殊管理药品（比如含类复方制剂）更要重点盘，这类药品不仅涉及税务，还受药监部门严格监管，台账里必须体现存储条件、温湿度记录等。

根据《药品经营质量管理规范》（GSP）要求，药品经营企业必须建立真实、完整的购销记录，注销时这些记录要作为库存盘点的依据。如果平时就没做好GSP管理，注销时补台账会非常痛苦——我见过有老板为了凑齐进货凭证，翻出十年前的进货小票，纸张都泛黄了，最后还是缺了几项，只能按账外收入补税，得不偿失。

第二步：分类处理，不同药品不同出路

盘点清楚后，就要对库存药品分类处理了。不是所有药品都能一刀切报损，不同效期、不同状态的药品，合规处理方式完全不同，这里面的坑可不少。

第一类：效期内、可正常销售的药品

这类药品是优质资产，处理方式也最灵活。常见途径有三种：一是转让给其他药店，二是通过正规医药公司回收，三是捐赠给有资质的慈善机构（比如红十字会、慈善总会）。这里要注意：转让或回收必须取得对方开具的正规凭证，比如增值税发票或收据，品名、数量、金额要和台账一致，不然税务不认。捐赠的话，根据《慈善法》规定，受赠方必须是登记或认定的慈善组织，并且要取得捐赠票据，这部分捐赠成本还能在企业所得税前扣除（不过注销企业可能涉及清算所得，具体要和税务确认）。

我之前帮过一个王总，他注销连锁药店分店时，有50万元效期内药品，本来想直接低价处理给员工，结果被我们劝住了——低价卖给员工没有合规凭证，税务会认定为向个人销售未视同销售，需要补缴增值税。后来我们联系了一家区域医药公司，按市场价8折回收，不仅拿到了合规凭证，还回笼了资金，王总直说早知道找专业人士了。

第二类：近效期但尚可使用的药品

这类药品处理起来要更谨慎。直接报损可惜，但正常销售又可能砸药店招牌。合规做法是：降价处理，且必须明确告知购买者效期，最好签订《近效期药品告知书》，保留购买凭证。如果没人要，也可以考虑捐赠给基层医疗机构（比如社区卫生服务中心），但前提是对方愿意接收，并且符合《药品管理法》关于不得使用超过有效期的药品的规定。这里有个风险点：有些老板会把近效期药品改批号改效期，这可是违法的，轻则罚款，重则可能涉及刑事犯罪，千万别碰。

第三类：过期、破损、变质药品

这类药品必须销毁，没有商量余地。销毁流程要严格：首先向所在地药品监督管理部门（通常是市场监督管理局）申请备案，提交《药品销毁申请表》、库存台账、销毁方案等材料；然后由药监部门监督销毁，最好全程录像，保留《药品销毁记录》；最后凭药监部门的《药品销毁确认书》和销毁记录，才能进行税务处理。我见过有老板图省事，把过期药品直接扔垃圾桶，结果被环卫举报，药监部门介入后，不仅罚款，还要求重新盘点所有库存，注销流程直接卡住。

第三步：税务处理，别让库存变成负债

库存药品处理完，税务处理是最后一道坎，也是最容易被忽视的。很多老板以为药品没了，报损就行，不用交税，这种想法大错特错。根据《增值税暂行条例实施细则》规定，企业注销时，库存商品（包括药品）如果未销售，需要区分情况处理：

如果是外购药品（大部分药店药品都是外购），进项税额已经抵扣过的，注销时需要做进项税额转出，转出的金额=库存药品成本×适用税率（一般是13%）。比如库存药品成本10万元，进项税转出就是1.3万元，这部分需要补缴增值税。如果之前没抵扣过进项（比如从小规模纳税人处采购），则不需要转出，但销售时需要按13%缴纳增值税（不过注销时一般不会销售了，所以这种情况较少）。

如果是自产药品（比如药店有制剂室，这种情况很少），则视同销售，需要按市场价计算销项税额。这里有个小技巧：如果市场价不好确定，可以按库存药品的组价（成本+利润）计算，但利润率建议控制在10%以内（参考行业平均），避免税务认为定价不合理而调整。

除了增值税，企业所得税也要考虑。库存药品如果正常销售，销售成本可以税前扣除；如果是报损（过期、破损等），需要取得《药品销毁确认书》、内部审批凭证等资料，作为资产损失在企业所得税前扣除。根据《企业资产损失所得税税前扣除管理办法》（国家税务总局公告2011年第25号），属于正常损耗的资产损失，只需留存备查；属于非正常损耗（比如管理不善导致过期），则需要专项申报，并提供相关证据。我见过有老板因为过期药品没有药监部门的销毁确认书，税务不认可资产损失，导致25万元成本无法税前扣除，白白多交了6万多元企业所得税。

注销药店库存管理：记住这3个避坑指南

做了这么多年财税，我发现注销药店时库存管理最容易出问题的，就是想当然。最后给大家3个实在的建议，希望能帮到你们：

1. 别拖！尽早启动库存盘点。注销决定一旦做出，马上开始盘点，别等到税务通知检查了才手忙脚乱。平时就做好GSP管理，进货、销售、库存记录清晰，注销时会省掉80%的麻烦。

2. 多问！提前和药监、税务沟通。不同地区对药品销毁、税务处理的执行可能有差异，比如有些地方允许线上拍卖处理效期内药品，有些地方对近效期药品捐赠有额外要求。提前跑一趟药监局和税务局，问清楚流程和资料要求，比事后补救强百倍。

3. 留凭证！每一笔处理都要有证据链。无论是转让、回收还是捐赠，发票、收据、合同、销毁记录、药监确认书……这些凭证一个都不能少。我常说财税工作就是凭说话，没凭证就是没发生，注销时更是如此，资料不全，流程就卡住。

上海加喜财税公司对财务凭证不完整，企业注销对知识产权有何影响？服务见解：企业注销时，财务凭证不完整（如进货发票缺失、成本核算依据不足）不仅会导致税务清算受阻、补税罚款，还可能影响知识产权的处置。例如，若企业拥有商标、专利等知识产权，但财务凭证无法证明其取得成本或研发投入，在注销时可能无法进行合法的价值评估和转让，甚至导致知识产权被悬置，影响原股东权益。加喜财税凭借15年企业注销服务经验，提供财务凭证梳理+知识产权专项评估+税务合规申报一站式服务，帮助企业补全凭证链，合规处置知识产权，确保注销流程顺畅，避免遗留法律风险。如需专业协助，欢迎访问加喜公司注销官网：https://www.110414.com。